生物除磷是指在生物反应池中，有机磷氧化成磷酸盐，进入微生物体内，从剩余污泥中排出的过程。基本原理在于强化微生物的厌氧释磷和好氧吸磷过程，培养嗜磷菌，使微生物体内的磷含量从常规污泥中的2%提高到3%以上，增加剩余污泥中的磷浓度，提高磷的去除量。
污水厂为达到一级a排放标准，多采用生物除磷工艺，如aao工艺，带厌氧缺氧段的氧化沟工艺等，但生物除磷效果常常不够稳定，常与tp≦0.5 mg/l的一级a标准常有一定偏差，除磷效果也容易受多种因素影响，造成出水指标的浮动。
化学除磷工序常常在生物除磷之后，根据测算，生物除磷（aao工艺）出水tp浓度一般在1.0 mg/l左右，出水悬浮物ss主要成份主要是活性污泥细碎絮体，含磷量约为3% 左右，按过滤后出水ss 5.0mg/l 计算，ss中的tp量为0.15 mg/l，那么化学除磷后tp应小于0.35mg/l,化学除磷的tp削减量为0.65 mg/l.因此，采用化学除磷工序作为生物除磷的补充十分必要。
化学除磷的原理在于添加高化合价的金属盐类化学药剂，一般经常使用的是三价铁盐、铝盐等，高价金属离子可与磷酸盐结合，形成溶解度低的磷酸盐化合物，溶解态磷转变为固态磷，但新形成的磷酸盐化合物是极细小的晶体，必须经过絮凝、沉淀过过滤等手段才能从污水中分离出来。
化学除磷只是单纯的化学反应以及物理化学的絮凝及固液分离过程，只要投加的药剂量适度，除磷效果是非常可靠的，而且污泥量增加不多，化学药剂经济要衡量。